La Direction d’ INGERTEC manage les départements et services suivants :
- Un Département « production d’énergie » = DPE
- Un Département « cycle du combustible » = DCC
- Un service « prestations de service intellectuelles» = PSI
- Un Département «industrie et nouvelles énergies» = DINE
- Un Département «défense» = DDEF
- Un Département « export » = DEX
- Un Département « production autonome » = DPA
- Des services support (coordination études, planification et ordonnancement, préparation et méthodes, analyse de risque et REX)
Chaque Département se décompose en secteurs d’activités :
- Projets et grands travaux
- Prestations et services de proximité
- Maintenance
Les fonctions supports (Direction Administrative et Financière (DAF), Service des ressources humaines (RH), la logistique d’hébergement et informatique…) sont assurées par MULTITEC.